术语表

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A

Atom —— 原子
这是保存一种元素化学性质最小物质粒子；原子一般由中性亚原子粒子(中子)，正电荷粒子(质子)和负电荷粒子(电子)组成。

Acquired Immunodeficiency Syndrome (AIDS) —— 获得性免疫缺陷综合征
一种由免疫缺陷病毒感染的人类传染病(HIV-1)，一种逆转录酶病毒引致免疫系统(immune system)失效或者衰弱和经常伴随着癌症或者第二传染病例如肺结核，但不限于肺结核。艾滋病传播经过直接体液接触。

AIDS-related Complex (ARC) —— 艾滋病相关联合体
一组症状，比如淋巴结肿大、发烧、体重减轻、腹泻和随着免疫系统(immune system)衰弱而得到的次机会疾病，这些感染人体免疫缺损病毒(HIV)的严重性都比艾滋病(AIDS)本身轻。某些情况是诊断艾滋病的先兆。也被叫作“艾滋病相关情况”或者“艾滋病相关综合症”。

Analogy (adj. Analogous) —— 类似(形容词.类似的)
两个解剖结构或者动作特性内部不同和不相关的生物体在各自的生物体内执行相同的功能，但不是来源于同一个祖先结构或者这生物体祖先共有的特性。取而代之，这种结构和特性个别激发和之后进化成执行相同的功能(或者类似的功能)。[译者注：这类器官生物学上称之为同功器官，同功器官是指功能相同，外表有些类似，但来源上不相同，基本结构上不相同的器官。例如鱼的鳃和陆生脊椎动物的肺是同功器官。同功器官不说明在进化上有共同来源，只说明用于相同功能的器官形成了相似的形态。与同功器官相对的是同源器官。同源器官一般是指那些起源相同或相似，而形态和功能完全不同的不同动物类群的一类器官。如鱼的鳍和人的手臂，有共同的胚胎起源，但在胚胎发育中形态发生了重大改变，执行的功能也完全不同。同功器官一般是指功能相同或相似，而起源不同的不同动物类群的一类器官，如鸟翼和蝶类的翅，尽管起源完全不同，但都执行飞行的功能。]

Antibody —— 抗体
一种能引致一个免疫系统(immune system)作出反应的实体，例如病毒(virus)或者细菌(bacterium)。

Antigen —— 抗原
一种能产生抗体的刺激物。

AutoDock
由 3 个独立的程序来产生和模拟分子之间的相互作用：AutoDock 执行配合基(ligand)的入坞到目标蛋白质(protein)的格群；AutoGrid 预先计算这些格；而 AutoTors 设置哪些结合物作为配合基(ligand)内可旋转的。

B

Bacteria (singular: Bacterium) —— 细菌
利用细胞分裂来繁殖单细胞原核生物体；通常有细胞壁；形状像球状、棒状，或者螺旋状；能够在实际上的任何环境发现。

Bioinformatics —— 生物信息学
基因和生物学信息数据(数据库)的计算机化描述，和通过使用软件工具转换和处理这些数据来带来更多久经世故的医学生物学方法理解。由于它在卫生科学、药物、生物技术工业应用上的预期冲击，生物信息学正在形成戏剧性的发展。它也被以激励有规矩的领域为目标而成为新大学学位的计划。

Biotechnology —— 生物学技术
通过基础研究来发展的用于生物或者生物学技术的产业。

C

Cell —— 细胞
最小具有复制能力的有膜包围的生物体。包括合作的组织和器官成分也包括自我平衡的微生物体。

Chromosomes —— 染色体
细胞的自我复制遗传结构包括细胞脱氧核糖核酸带到它的线性基因排列核苷酸序列。在原核生物里，染色体脱氧核糖核酸是圆形的，整个基因组是载在一个染色体上的。真核基因组包含许多染色体，而它的脱氧核糖核酸由不同种类蛋白组成的。

Computational science —— 计算科学
利用计算模拟(见下一条术语)整理某些自然现象作基础科学的研究，特别是那些不能在实验室环境学习的，例如宇宙学现象。这些功能包括学习更多关于在人体内一些特别的化学作用(例如在这项目分子是怎样接合其他分子)， 预计最接近的飓风的路径，或者设计在某些环境下具有特殊特性的材料，例如，坚硬，弹性，耐用。经常被称为除了实验室和理论工作以外的“第三种模式”。经常用于协调观测科学确认代码。例如，观察数据能够用作输入参数的代码，然后这代码的输出和观测数据比较在这个自然事件过程的下一个时间步，例如飓风或者地震的级数。这个过程还可以用于校验或者普及或者校正代码的精度，它将来会更准确预知这些事件。 

Computer Modeling —— 计算机建模
模式的结构在计算机上利用未加工的数据来模拟一个对象或者对象的交互。在 Bioinformatics (生物信息学)上，计算机建模用于确定大小，形状，和某些化学物的相互作用来开发治疗相关某些疾病。

Computer Simulation —— 计算机模拟
一个软件程序运行于任何大小的计算机来尝试模拟某些建立于一个科学家的概念和现象的数学理解的现象。这些科学家的概念理解转化成算法或者数学逻辑，这些是用很多种程序语言(Fortran、C、C++等)的一种来编写成的，和编译成二进制代码运行于计算机。等同于，在计算机上运行一个代码的动作。

D

Data —— 数据
待分析的原始信息。

Database —— 数据库
为了方便计算机检索而特意收集在一起的数据。数据的存储方式便于调整。

Deoxyribonucleic Acid (DNA) —— 脱氧核糖核酸
一种结构非常复杂的核酸，它是生物细胞染色体的主要成分。

Disease —— 疾病
身体任何部分、器官和(或)系统的结构或功能的偏离正常或停止，表现为颇具特征性的症状及体征，病原、病理及预后有些已被阐明。也可以查看“传染病”条目。

Docking —— 分子对接
一种计算机模拟软件，用来模拟分子间的相互作用，并通过分析特定分子的药物疗效来选择可进一步研究分子组合。

E

Entropia Network —— Entropia 网络
通过 Entropia 2000 系统将因特网上的计算机链接在一起构建成的一个虚拟的高性能超级计算机集群，它能为科学研究、慈善事业、商务应用提供大规模的海量计算能力。

Enzymes —— 酶类
酶是一种能在生化反应中起到催化剂作用的蛋白质，它能够加快生化反应的速度，但不改变反应的进行方向和性质。

F

Fomite —— 污染物(染菌物)
包含病原体的对象能够传播疾病。物体(如书、木器或一件衣着)本身无害，但因携带病原微生物而成为传播一种传染病的物体，此物体即为污染物。

G

Gene —— 基因
最根本的遗传物质和功能单位。脱氧核糖核酸分子段，包含合成某一产物(多肽链或核糖核酸分子)所需要的全部信息，包括密码和非密码顺序。基因是遗传和自身繁殖的生物学单位；并通过双亲传给子代。每个基因在染色体图上有一特定的位置(座位)。从功能观点看，可把基因设想为构造基因、操作基因和调节基因。

Genbank —— 基因库
一个大型的核酸、蛋白质序列数据库，由美国国立医学图书馆(National Library of Medicine，USA)提供：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

H

HIV —— 艾滋病病毒
请查看“Human Immunodeficiency Virus”词目。

Homology (Homologous) —— 同源(形容词.同源的)
生物体各部分之间，在形态学上有等价的关系时，把这个关系称为同源。是比较形态学的最基本概念。异种生物在体制上显示同一配置的构造中有某些共同点的器官，即使其机能和形态上有不同，也是等价的，应该看作是同源。这个认识是从圣希莱尔(E.Geoffroy Saint-Hilaire)等开始的，他把这个关系用相当于现在的相似的言词去称呼(The orie-des analogues)。把相似与同源区别开来的是欧文(Owen，1843)。不久，同源被认为是了解生物的系统发生、亲缘关系的重要线索，因为同源器官被看作是来源于共同祖先的器官。同时，在同源的认定上被加上了来源于同一胚层的胚胎学事实，以后又加上了对具有同样发生能力的胚区，在同样造形影响作用下所生成的器官互为同源的实验形态学的标准。但是，与此相反，同种器官来源于异种动物的不同胚层的，也屡见不鲜。因而有人提倡同源应该回到纯粹的比较解剖学的定义上去(A.Remane.1956)。为了区别上述纯形态学的、进化的、实验形态学的三种同源，有的称为形式同源、历史同源、成因同源。而且，“同源”一词，在比较同一个体的各部分时也逐惭被引用。这种同源称为一般同源，以与上述特殊同源相区别。而一般同源被不同学者作种种分类，如格金鲍尔(K．Gegenbaur)把它分成(1)左右对称器官间的同源(同型，例如脊椎动物的左前肢与右前肢)。(2)沿体轴方向排列的部分间的同源(同价，例如脊椎动物的前肢和后肢)。(3)同一器官的部分间的同源(同规，例如脊椎动物前肢指间的同源)。(4)排列在体轴以外的方向的部分间的同源(同义，例如脊椎动物的上腕骨与前腕骨)。并且同源的概念由上述以器官为主的关系扩展到染色体组(相同染色体组)、染色体(同源染色体)和各种生物化学物质(生化的同源)等等。
起源相同，结构和部位相似，而形态和功能不同的器官。在脊椎动物方面，如鱼类的胸鳍，鸟类的翼和兽类的前脚都是前肢的各种状态，属同源器官；在高等植物方面，如皂荚枝上的刺，葡萄的卷须，洋葱的鳞茎和马铃薯的块茎，虽然形态上区别极大，但都是茎的变态，也属同源器官。同源器官的存在，是支持生物进化观点的一种间接证据。

Homology modeling —— 同源性模拟法
同源性仿真法(Homology modeling)也叫做比较性模拟法(comparative modeling)或者知识基础模拟法(knowledge-base modeling)。应用这一个方法可以快速的仿真蛋白质的三维结构(3D structure)。目现已有一些人从事某些物种(species)的整个基因体蛋白质结构仿真。例如英国已仿真出酵母菌(yeast)的整个蛋白质结构。 
同源仿真法(Homology Modeling)基本假设是蛋白质分子结构具有某种规则性，其可能三维结构的基本形态种类有限，各个形态是由几种特定的胺基酸序列所构成。 
关于这种方法的详细解释，请参阅：http://psr.life.nthu.edu.tw/psm/hm.htm (繁体中文)

Hormone —— 荷尔蒙(激素)
体内某器官或其细胞产生的一种化学物质，对某一或某些器官的活动有特殊的调节功能；最初指各种内分泌腺所分泌的物质，并经血液输送，到达靶器官而产生效应，后来激素一词亦指那些不是由特殊腺体所产生，而具有相似作用的各种物质。

Human Immunodeficiency Virus (HIV) —— 人类免疫缺陷性病毒(HIV，艾滋病毒)
一种能使免疫系统功能失灵或削弱的病毒。艾滋病病毒是通过体液（血液、精液、阴道分泌液）交换，或通过母亲传给胎儿等途径进行伟播的。
艾滋病病毒传播途径通常有以下三种：
①性行为传播：异性或同性在进行性交、肛交和口交等性行为时生殖器官的皮肤、黏膜会轻微擦伤，尽管这种擦伤的程度轻微到肉眼看不到，自己也感觉不到，但若一方带有艾滋病病毒，微小的艾滋病病毒就会乘虚而入。这是艾滋病传播的主要途径。
②血液传播：共用被艾滋病病毒污染而末消毒的注射器吸毒，使用了受污染又末消毒或消毒不合格的注射器、针头、手术器械、理发刀具，输入含艾滋病病毒的血液或血液制品，破损、溃疡的皮肤黏膜接触了含有艾滋病病毒的血液、体液时，都会感染艾滋病病毒。
③母婴传播：已被艾滋病病毒感染的孕妇分娩前通过胎盘，分娩时通过产道，分娩后通过哺乳可将艾滋病病毒传播给婴儿。

I

Immune System —— 免疫系统
免疫系统是由特异性和非特异性细胞、组织和器官组成而成。在外来微生物侵入身体，对身体造成伤害之前，辨识出这些微生物并消灭它们。免疫系统的功能正常，就能及时消灭侵入体内的致病细菌、病毒等微生物，还能预防肿瘤的发生。

Immunoglobulin —— 免疫血球素(免疫球蛋白)
结构上与糖蛋白有关，功能上作为抗体的物质。根据结构和生物学活性，免疫球蛋白有五类(IgM、IgG、IgA、IgD 和 IgE)。它是一种能对抗原产生束缚作用的抗体蛋白质，是公共传染病的克星。

Infectious Disease —— 传染病
传染病，即传染性疾病，是由病原体(细菌或病毒)引起的，能在人与人、动物与动物或人与动物之间相互传染的疾病。它是许多种疾病的总称。 最常见的传染病有流行性感冒、艾滋病(AIDS)、乙肝、细菌性痢疾、流脑、结核病、急性出血性结膜炎等。而糖尿病、痛风等等不是传染病。

Internet —— 因特网
您不是正在上网冲浪吗？

J

Joining Segment —— 连接区段(连接片段)
小片段 DNA 链接成能实现一定功能的免疫球蛋白(immunoglobulin)的基因(genes)序列。

K

Karyocyte —— 有核细胞
自然界里几乎所有的生物细胞(cell)都有一个细胞核。

L

Ligand —— 配合基
一种能对其他分子产生束缚的分子，特别常见的是某种低分子化合物对某些大分子化合物的束缚，例如，抗原(antigen)对抗体(antibody)、激素(hormone)对器官的束缚。在药物设计过程中，一个配合基就可能是一个候选的药物分子。

M

Microorganism (microbe) —— 微生物(细菌)
肉眼难以识别的微小的有机生命体，具医学意义的有细菌、立克次体、病毒、霉菌及原虫。

Molecule —— 分子
一种极小的物质块，或能独立存在的最小物质，由原子聚集而成，特别是二个以上原子结合的特种化合物；将其分解为组成的原子，可改变分子原有的特性；分子中原子的数目和种类随不同化合物而异。

N

Nucleic Acid —— 核酸
高分子(molecule)量核苷酸(nucleotide)聚合物，有脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)两种。

Nucleotides —— 核苷酸
核酸酶分解核酸形成的一个化合物，由一个碱基(嘌呤或嘧啶)，一个糖(核糖或脱氧核糖)及一个磷酸构成。核苷一磷酸是有代表性的一系列品种。多个核苷酸连接成锁状的物质叫聚核苷酸。核苷酸是构成脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(DNA)的基本组成单元，在所有生物的细胞中都存在。

O

Organ —— 器官
动物体或植物体的由不同的细胞和组织(tissues)构成的结构，用来完成某些特定功能，并与其他分担共同功能的器官一起组成各个系统(动物体)或整个个体(植物体)。

P

Pathogen —— 病菌、病原体
可以导致疾病(disease)的一种微生物(microbe)或者其他类型的有机体。

Protein —— 蛋白质
一种由一条或多条按一定次序排列而成的氨基酸链复合而成的大分子(molecule)。细胞核内的基因传递遗传信息，促使不同种类的氨基酸按某种指定的顺序构成特定的蛋白质。蛋白质在生物体内有着及其重要的作用，它是构成人体细胞、组织、器官的必不可少的化学物质，不同结构的蛋白质，执行的功能是不同的。例如：激素类(hormones)、酶类(enzymes)、抗体。

Q

Quantum Speciation —— 量子式物种形成
一种新类型的能够让地理上完全隔绝的小部分人口遗传其父系或母系染色体信息迅速演变的物种形成方式。这种方式通常在物种的物理性质上伴随着大规模变化。许多病毒(譬如艾滋病)以此类方式繁衍，这给寻求治疗方法增添了大量的困难。[译者注：量子式物种形成方式就是远缘杂交通过染色体加倍后形成异源多倍体新物种。自然界中新物种的形成方式有多种，但常见的方式只有两种，其一是地理物种形成，其二是量子式物种形成。量子式物种形成方式主要见于植物界，也就是远缘杂交通过染色体加倍后形成异源多倍体新物种。不同种、属的两个物种之间由于存在生殖隔离，杂交后代是高度不育的。因为亲缘关系较远的物种之间，杂交后代体细胞中的染色体组来自不同物种，细胞中没有同源染色体，在减数分裂中没有同源染色体的联会和分离，不能产生正常生殖细胞。但如果杂交后代个体染色体数目自然加倍，体细胞中同源染色体恢复成对，在减数分裂中，同源染色体能正常的联会和分离，能产生正常的生殖细胞，就成为可育的异源多倍体。这种多倍体生物一旦形成，就与原来的物种形成生殖隔离，基因不能自由交流，因此是一个新物种。由此可见，在自然条件下这种物种形成过程必须连续经过两步：第一步要实现种间杂交或属间杂交；第二步，杂交后代染色体自然加倍。这两步要连续发生，缺一不可。由于这只需经过一二代的很短时间就能产生新物种，故又称快速物种形成或暴发式物种形成，是形成新物种的重要途径。]

R

Rational Drug Design —— 合理药物设计方法(RDD)
结构化的药物设计严重依赖于计算机的处理，计算机可以对现有的一类药物建模，然后修改以产生新的药物或者针对一个选定的分子进行测试以了解其疗治疾病的功效。[译者注：合理药物设计(RDD)方法能够加速药物研发的过程。合理药物设计既包括在蛋白质受体已知的理想情况下对小的有机分子进行设计和优化，也包括仅有一系列已知结构的苗头化合物可供利用的极端情况下的分子设计和优化。RDD 可设计和优化有机小分子药物，从蛋白质结构已知的理想案例到通过高通量筛选出极少量目标分子的特殊案例都可进行。这种对基于结构、基于类似物和组合化学数据库设计都适用的创新技术可使你在你的药物靶点研究中有效地利用各种可能的信息资源。]

Ribonucleic Acid (RNA) —— 核糖核酸(RNA)
一种复杂的化合物，存在于生物体细胞核、细胞质和核糖体蛋白质上的带有遗传信息的单链。[译者注：从细胞的细胞核和细胞质部分分离出来的化学物质。在蛋白质合成和其他生化反应中起着重要作用，RNA 的结构和 DNA 的结构类似，都是有核苷酸按照一定顺序排列成的长链。RNA 可以分为信使 RNA、转运 RNA、核糖体 RNA 以及其他类型的 RNA。RNA 为单链结构，存在于所有生命体的细胞核、细胞质，以及核糖体蛋白质中。]

S

Sexually Transmitted Disease (STD)  —— 性传染病(STD，性病)
通常或时常在人与人之间经直接性接触(肛交、性交，或口交)而传播的疾病(如梅毒、淋病、艾滋病，或其他生殖器型疱疹)。HIV 是最常见而且最易传播的性病。

Strain
A population of cells that are descended from one single cell. Can also refer to a virus that has descended from a particular type of a specific virus.

T

Tissue —— 组织
在多细胞生物体内执行某些相同或相似功能的特定细胞的组合。

U

UI RNA —— U1 RNA
一种用于接合或去掉信使 RNA 外显子的小分子核糖核酸。[译者注：snRNA 主要存在于细胞核中，也存在于细胞质中，占细胞 RNA 总量的 0.1%～1% ，分子大小为 58～300bp，称为小分子 RNA。其中 5' 端有帽子结构，分子内含 U 较多的称 U-RNA，不同结构的 U-RNA 称为 U1，U2 等；5' 端无帽子结构的按沉降系数或电泳迁移率排序，如 4.5SrRNA、7SrRNA 等。SnRNA 多于蛋白质结合在一起，以核糖核蛋白(RNP)形式存在。U-RNP 在 hnRNA 及 tRNA 的加工中有重要作用。其他在控制细胞分化，协助细胞内物质运输，构成染色质等方面均有重要作用。]

V

Vestigial —— 退化的器官
一些功能逐步退化或完全消失的器官或部分，它们是生物从原始祖先开始进化的过程中留下的“遗迹”。人类的阑尾就是一个典型的例子。

Virus —— 病毒
A一种能在寄主细胞中自我复制或繁殖的生物单体。病毒以核酸的形式附着在蛋白质的表面；有些动物病毒表面包着一层膜。在被传染的细胞内部，病毒利用寄主细胞内的物质资源繁衍自己的后代。

W

Wandering Macrophage —— 游动的巨噬细胞
一种可以离开血管并可游动到被传染组织的巨噬细胞。

X

X Chromosome —— X 染色体
一种存在于任何动物细胞内的异型配子的性染色体。在以 XY 体系决定性别的动物细胞内，有一对性染色体，分别为 X 染色体和 Y 染色体，男女的性染色体有差别，女性的性染色体为二个大小形状相同的 X 染色体。男性的性染色体则只有一条 X 染色体，另外还有一条较小的 Y 染色体，性染色体是决定性别的物质基础，人体细胞每一对成双的染色体叫同源染色体，其中一条来自父亲，一条来自母亲。

X-ray Crystallography —— X 射线辐射结晶学
一种通过分析 X-射线衍射图样来确定分子三维结构的技术。

Y

Y Chromosome —— Y 染色体
一种存在于男性细胞内的异型配子的性染色体。大多数哺乳动物种类通过 Y 染色体来决定个体的性别为雄性，由 Y 染色体上的基因触发荷尔蒙的产生。人体内有一对性染色体，分别为 X 染色体和 Y 染色体，男女的性染色体有差别，女性的性染色体为二个大小形状相同的 X 染色体。男性的性染色体则只有一条 X 染色体，另外还有一条较小的 Y 染色体，性染色体是决定性别的物质基础，人体细胞每一对成双的染色体叫同源染色体，其中一条来自父亲，一条来自母亲。

Z

Zymosis —— 传染病
任何有传染性的疾病。

Many of the terms used in this glossary have been colleted from BioTech Resources Web Project at the University of Texas Institute for Cellular and Molecular Biology. For a more comprehensive list and a searchable database of terms, go to http://biotech.icmb.utexas.edu.