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本帖最后由 WaltherNernst 于 2011-9-18 21:30 编辑
什么是艾滋病？
艾滋病，即获得性免疫缺陷综合症（又译：后天性免疫缺陷症候群），英语缩写AIDS（Acquired Immune Deficiency Syndrome）的音译。1981年在美国首次发现和被确认。曾译为“爱滋病”、“爱死病”。分为两型：HIV-1型和HIV-2型，是人体感染了“人类免疫缺陷病毒”（HIV - Human Immunodeficiency Virus）（又称艾滋病病毒）所导致的传染病。艾滋病被称为“史后世纪的瘟疫”，也被称为“超级癌症”和“世纪杀手”。
艾滋病，是种人畜共患疾病，由感染"HIV"病毒引起。HIV是一种能攻击人体免疫系统的病毒。它把人体免疫系统中最重要的T4淋巴组织作为攻击目标，大量破坏T4淋巴组织，产生高致命性的内衰竭。这种病毒在地域内终生传染，破坏人的免疫平衡，使人体成为各种疾病的载体。HIV本身并不会引发任何疾病，而是当免疫系统被HIV破坏后，人体由于抵抗能力过低，丧失复制免疫细胞的机会，并感染其它的疾病导致各种复合感染而死亡。艾滋病病毒在人体内的潜伏期平均为9年至10年，在发展成艾滋病病人以前，病人外表看上去正常，他们可以没有任何症状地生活和工作很多年。
关于整合酶
整合酶是逆转录病毒（也叫反转录病毒，HIV属于此类病毒）中，负责将病毒基因组DNA整合入宿主染色体中的一类酶。通过一系列DNA切割与连接反应催化部位特异性的整合。这个整合过程是HIV病毒复制和传播所必需经过的过程，抑制整合酶的活性也就抑制了病毒的繁殖。通常整合酶由病毒自身携带，并且不存在于宿主细胞，所以可以作为抗病毒药物的一个合适靶标。
近年来，北京工业大学的王存新教授领导的科研小组致力于整合酶抑制剂筛选方法的研究，并取得了丰硕成果。而斯坦福大学的Folding@Home小组，则利用全世界数千万志愿者贡献的运算能力，成功展开了整合酶的DNA粘着区域，为整合酶抑制剂的研究提供了新的方向。
Folding@Home项目
Folding@home是一个研究研究蛋白质折叠，误折，聚合及由此引起的相关疾病的分布式计算工程。蛋白质是一个生物体系的基础，它们是一个个纳米级机器。在蛋白质实现它的生物功能之前，它们会把自己装配起来，或者说是折叠；折叠过程对人类而言仍是未解之谜。当蛋白质没有正确折叠（误折）无疑会产生严重的后果，包括许多知名的疾病，比方阿兹海默症(Alzheimer's)，疯牛病(Mad Cow, BSE)，帕金森氏症(Parkinson's)等。该工程使用联网式的计算方式和大量的分布式计算能力来模拟蛋白质折叠的过程，并指引对由折叠引起的疾病的一系列研究。
最令人惊讶的不仅是蛋白质本身能够自我组装—— 折叠，而且是它们自我组装的速度是如此之快:一些蛋白质能够在百万分之一秒之内完成自我折叠。虽然这个时间在人的时间表中是非常快的，但是用计算机进行模拟，这个时间就显得相当长了。实际上，计算机模拟1纳秒（1/1,000,000,000秒）需要花费大约一天的时间。不幸的是，蛋白质折叠是以数十毫秒（10000纳秒）作为时间表的。这样，这将需要10000台计算机花费数天的时间来模仿折叠。——或者需要30台计算机花费数年的时间。这样等一个结果出来需要的时间太多。
看似简单的蛋白质，却是生命活动的基础
Folding@home并不依靠强大的超级电脑进行计算，反而主要的贡献者是成千上万的个人电脑。每部参与的电脑都安装了一个在背景执行的客户端程序，在系统不忙碌的时候调用中央处理器执行模拟工作。现时世界上绝大部分的个人电脑，在一般的情况下都很少用尽本身的计算能力。Folding@home就是使用这些本来都浪费了的运算力量。
参与Folding@Home项目是完全自愿的，因为除了不断上涨的积分外，没有任何的回报。但是当你看到因为自己的运算而攻克一个又一个的不治之症时，你会无比自豪，会为自己作为Folding@Home大家庭的一员而骄傲！
Folding@Home的客户端会定时连接设于美国斯坦福大学的服务器去取得“工作单元”（work units），即一种存有实验资料的数据包，根据实验资料进行计算。每个工作单元计算完成后，再传回服务器。
Folding@home的用户端利用了经修改的TINKER、GROMACS、AMBER及CPMD这四款分子模拟程式进行运算，并会在许可的情况下作出优化，以把运算速度加快。这四款模拟程式也被修改成多个不同版本，供多款作业平台使用，每款程式的变体会以编号“Core xx”作分类。
Folding@Home在中国
在中国，由于国民素质和对Folding@Home的认知度等问题，国内参与该项目的人少之又少，到2011年9月为止，Folding@Home项目的中国国家队 China Folding@Home Power（编号3213）有记录的参与者不到3200人，活跃用户（近期有数据包返回）仅有146人。相比之下，海峡对岸的台湾FAHer算力更强劲，于2009年超越3213。但是，我们的骨子里有一种不甘落后的精神，经过3年的不懈努力，3213有望在今年10月反超台湾队。
加入我们吧！
不需要高深的电脑技术，只要你有一台能上网的电脑，就可以加入Folding@Home运算，利用自己电脑闲置的运算能力，为人类早日攻克诸如可传播性海绵状脑病（包括疯牛病、克—雅氏病、格-斯氏综合征等）、癌症、获得性免疫缺陷综合征（即艾滋病）、阿兹海默症（老年痴呆症）、亨廷顿舞蹈症（本项目运算能力最强的个人是一位家族性亨廷顿舞蹈症患者）等目前无法治愈的疾病作出自己力所能及的贡献。
下面进入正题，如何加入Folding@Home（以下简称FAH或F@H）
首先，要先申请一个用户名和密钥（passkey，用作唯一用户标识） 打开http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/getpasskey.py，在输入框中填入自己想要的用户名和能收到邮件的电子邮箱地址，点击Get Passkey，斯坦福会将passkey发到你的邮箱。
下载程序
FAH的客户端分为单核CPU版，多核CPU版（smp和bigadv）和GPU版，下面以单核CPU为例介绍设置方法
下载文件（由于文件尺寸限制，分为4个压缩分卷，全部下载后放于同一文件夹内解压）
FAH.part01.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7498)
FAH.part02.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7490)
FAH.part03.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7592)
FAH.part04.rar
(328.69 KB, 下载次数: 7397)
将文件解压到你能找到的地方
运行setup.vbs （在qiyuwanjia兄弟编译基础上修改），根据提示输入信息。
用户名为自己刚刚注册的用户名
队伍建议填写中国国家队的编号 3213（默认值）
密钥（passkey）为斯坦福发到邮箱中的32位字符串
存盘间隔从3-30分钟任选，建议为3分钟，防止因死机、断电等原因造成运算进度丢失
CPU占用率建议为100（FAH具有最低的进程优先级，当其它程序需要占用更多的CPU时，FAH进程会自动让出资源）
机器ID，这个只要在运行多个FAH时互不相同就行了
全部设置完成后，双击Folding@home-Win32-x86.exe即可启动运算，程序会自动下载运算核心和数据包进行计算。本压缩包已经包含78和a4两个核心，因此可能没有下载核心这个步骤。
运行界面
单核CPU版仅仅占用一个核心，如果你有多核心CPU（如有超线程技术，则一个线程视为一个核心），则可运行多个程序，只需要在设置复制文件夹并重命名，分别设置即可（注意保持编号互异）。
GPU和SMP&bigadv设置方法类似，不再赘述。
GPU程序：必须使用支持通用计算的GPU，N卡（nVIDIA芯片）好于A卡（AMD/ATI芯片）
命令行：
FAHGPU.part01.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7341)
FAHGPU.part02.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7192)
FAHGPU.part03.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7455)
FAHGPU.part04.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7548)
FAHGPU.part05.rar
(808.09 KB, 下载次数: 7273)
已包含CORE11和CORE15
图形界面：
FAHGPU3.part01.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7671)
FAHGPU3.part02.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7105)
FAHGPU3.part03.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7589)
FAHGPU3.part04.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7330)
FAHGPU3.part05.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7655)
FAHGPU3.part06.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7286)
FAHGPU3.part07.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7361)
FAHGPU3.part08.rar
(164.03 KB, 下载次数: 7201)
已包含CORE11和CORE15，多GPU可运行多个程序，但只有一个能使用图形界面，其余请使用命令行版本
SMP&bigadv：
FAH6.34.part01.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7328)
FAH6.34.part02.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7043)
FAH6.34.part03.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7345)
FAH6.34.part04.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7430)
FAH6.34.part05.rar
(976.56 KB, 下载次数: 7295)
FAH6.34.part06.rar
(68.63 KB, 下载次数: 7068)
SMP&bigadv务必填写passkey，并保证passkey正确，因为斯坦福要根据passkey给奖励分。SMP&bigadv对CPU要求高较，不推荐笔记本使用。
查看成绩
作为参与者，当然要知道自己的积分，一般可以查看斯坦福官方的统计
http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/main.py?qtype=userstats
搜索自己
搜索结果页
统计结果页
还有两张证书
也可以查看EOC的统计（EOC的统计基于官方）
http://folding.extremeoverclocking.com/
找自己
搜索结果
统计结果
注意事项
FAH的运行会对大型游戏等应用造成影响，如果觉得玩游戏太卡，可以关闭FAH。图形界面请在系统托盘（屏幕右下角，任务栏最右侧）的FAH图标上单击右键选择Quit，命令行请用Ctrl+C组合键。不要强行关闭程序，尤其不要用任务管理器之类的进程管理工具结束FAH进程，这样会导致正在运算的工作包直接作废！
运行FAH会使CPU、GPU满负荷工作，耗电量、发热量和噪音也会有相应增加。温度过高常常会导致电脑死机，无故重启，运行变慢等问题，不论是否参与FAH计算，都请注意电脑的散热，尤其是笔记本。例如：架空笔记本，放置于金属等导热表面而不要放在床等绝热表面上，有条件的还可以配置笔记本散热架。台式机则要定期拆开，清理灰尘，笔记本也应隔一段时间清灰一次，保证散热系统正常工作。 |
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发表于 2011-9-17 20:16:30
发表于 2011-9-18 12:59:53
