F@H项目蛋白质图像的手动查看方法

lothlorien

因为Core22和CoreA7没法直接在控制台上查看正在运行项目的实时计算图像，于是找到了一种手动向屏保程序载入图像数据的方法
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1、如图，找到FAH的项目数据存储路径并打开，我设置的是\FAHClient\DATA\work，其中work是数据目录下的工作文件夹，打开要查看的计算项目文件夹如00，01，02等
（默认安装的数据目录位置是 C:\Users\（你的用户名）\AppData\Roaming\FAHClient\work 或者 C:\用户\（你的用户名）\AppData\Roaming\FAHClient\work，我的是手动指定的数据目录）

2、同时选中viewerFrameXX.json和viewerTop.json文件（其中XX是指数字，其编号大小和计算完成情况有关，大的更接近计算完成的状态），根据我的测试，第一个文件是原子位置数据，第二个文件是染色和原子信息文件

3、另外单独打开客户端的根目录\FAHClient并找到FAHViewer.exe，将前面选中的json文件一块拖到exe上打开即可
（默认安装的客户端根目录位置是C:\Program Files (x86)\FAHClient，我的是手动指定的安装目录）
注：原子结构是固定的，想要查看最新的数据就得找数字最大的json载入，需要定时手动更换json打开

补充：如果同时选择同一项目足够多的viewerFrameXX.json和viewerTop.json文件（比如viewerFrame0.json~viewerFrame100.json和viewerTop.json）那么你将能看到你所进行的计算是如何逐步算出分子结构的，它将会是一个折叠过程的循环动画
PS：你甚至可以等项目计算完的时候在提交完成之前把全部的json文件存档留作纪念，占用空间并不是很大

补充2：根据观察，在空间填充模型（球模型）显示下：黑色是碳原子 C，白色是氢原子 H，红色是氧原子 O，蓝色是氮原子 N，黄色是硫原子 S，磷原子仍有待观察中......紫色粒子性质不明，仍在观察中......（根据最近观察，紫色粒子同时代表了多种原子，类似一种通配占位符）

补充3：关于FAHViewer的使用，左右方向键控制旋转，+、- 键控制帧速率，数字键改变显示方式，鼠标滚轮放大缩小

另注：手机阅读需要点击图片查看大图

lothlorien

2楼是基于GPU的core22最新的beta包13873项目的蛋白质图像,其中紫色粒子是还未计算完成的部分(猜测错误，仍有待研究中)，根据官方说明应该是人类催产素受体的模拟

Folding@home Project Description
Projects 13873
Cause: unspecified

This is a simulation of the human oxytocin receptor.

分子量确实大，怪不得跑的时候GPU负载这么高

lothlorien

这是新冠的coreA7的CPU包，项目14343是抗体与病毒蛋白片段的复合物

14335 - SARS-CoV-2 RBD domain in complex with human neutralizing S230 antibody Fab fragment (PDBs: 6nb8, 2ghv) [http://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2018.12.028]
14343 - clone of 14335

lothlorien

今日更新：基于A7内核的CPU项目13871 ，是人体中的一种肌球蛋白，是负责人体产生的大部分力的蛋白质

Folding@home Project Description

Projects 13800-13802,13804-13806,13819-13830,13870,13871

Cause: unspecified

This project simulates several myosins found in the human body. Myosins are the proteins responsible for most of the force generated by the body, from the contraction of muscles to the movement of materials around the cell. Although superficially similar, myosins actually differ substantially in their properties and distribution in the body. This project is studying those differences, especially the differences in speed and power. We are especially interested in how this might help us understand diseases that result from defects in myosin, including Usher syndrome and, especially, hypertrophic and dilated cardiomyopathies. Myosin was featured as the PDB Molecule of the Month in June 2001.

lothlorien

又是一个新冠的包，基于A7核心的CPU运算项目14344，是人体中ACE2受体与冠状病毒片段的结合体

Cause: covid

CORONAVIRUS PROJECT

14336 -SARS-CoV-2 RBD domain in complex with human ACE2 receptor (PDB: 6vsb, 6acg)
14344 - clone of 14336

lothlorien

基于Core22的GPU运算的新冠研究项目14543，内容为病毒表面的某种蛋白质，其中紫色粒子猜测是钠离子 Na+（仅对本项目而言）

Folding@home Project Description
Projects 14530-14590
Cause: covid-19

CORONAVIRUS PROJECT

Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) proteins.

These are high-priority projects to simulate the proteins of the COVID-19.   

At the time of release, this is the latest news report:  https://foldingathome.org/2020/03/10/covid19-update/

avatusxan

棒呆！我终于能看到我在叠什么了

Keyco

avatusxan 发表于 2020-3-25 22:12
棒呆！我终于能看到我在叠什么了

如果是金砖该是多好啊！

avatusxan

Keyco 发表于 2020-3-25 22:23
如果是金砖该是多好啊！

你要这样想，也许现在正在叠的药将来量产了以后能便宜点呢

Keyco

avatusxan 发表于 2020-3-25 22:27
你要这样想，也许现在正在叠的药将来量产了以后能便宜点呢

确实可以省去一部分研发费用和时间成本。至于药，以药养医的国度里面，再结合目前的医保情况，除非上面愿意用医保覆盖，不然大家只能继续养医。

倒是有“曲线救国”的可能，美国研发出了药或者疫苗，印度么开始仿制，然后么用仿制把进口药的价格拉下来。

avatusxan

Keyco 发表于 2020-3-25 22:36
确实可以省去一部分研发费用和时间成本。至于药，以药养医的国度里面，再结合目前的医保情况，除非上面愿 ...

你一定是看过药神

Keyco

avatusxan 发表于 2020-3-25 22:42
你一定是看过药神

真没看过。是因为有个要好的同学在国企医药公司上班的，所以一直会讨论。