标题: 关于UD的几个小白问题
shjiaohan
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发表于 2005-4-11 18:42  资料  短消息  加为好友 
关于UD的几个小白问题

1、是否在运算是不是只要看cpu运行情况啊?
2、ud的任务是下载过来的么?(怎么好象下载的东西很小的样子)怎么看下载过来的任务大小啊?
3、运算完了怎么办?不用管了么?
4、关机会影响运算么?(开机要重新来过么?)

哎~~~这个东西没有参与感啊!完全是不知不觉的

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roka
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发表于 2005-4-11 19:11  资料  主页 短消息  加为好友 


QUOTE:
shjiaohan  在 2005-4-11 06:42 PM 发表:

1、是否在运算是不是只要看cpu运行情况啊?
2、ud的任务是下载过来的么?(怎么好象下载的东西很小的样子)怎么看下载过来的任务大小啊?
3、运算完了怎么办?不用管了么?
4、关机会影响运算么?(开机要重新 ...

1,cpu 100% 但是不会影响你的其他工作
2,是的 你看看安装目录
3,完了会自动上传 再下载新的
4,不会 下次继续算

建议算WCG







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发表于 2005-4-11 19:24  资料  短消息  加为好友 
感谢roka的回答

不过以后不要发太水的贴.注意贴子质量.

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shjiaohan
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发表于 2005-4-11 19:48  资料  短消息  加为好友 
说了是小白啊

都说了,我是小白啊!

我还有几个问题
1、ud、wcg和FAD的项目是互通的么?
2、计算出来的东东专利是老外的么?(是老外的,我就不参加了)
3、中国有这方面的计算项目么?

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发表于 2005-4-11 20:10  资料  短消息  加为好友 
对不起,我是说roka不要发水贴

欢迎你提问...

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发表于 2005-4-11 20:13  资料  短消息  加为好友 
回答你问题

1, ud 和wcg软件类似但计算项目不同,FAD则完全不同.
2, WCG承诺所有计算结果只供科学研究,不作商业用途的.
3, 中国目前好像还没有类似项目.

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shjiaohan
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发表于 2005-4-11 20:39  资料  短消息  加为好友 
还有问题

我是在制药行业工作的,我发现在UD已经完成的cancer的项目中,有好几个分子是国外制药企业正在开发中的抗癌药物,怎么会这样?

另外洛氨酸激酶(PTK)极其相关的分子是目前很有潜力的一类药物,如:格列卫(洛氨酸激酶抑制剂)用于治疗CML和间质来源的恶性肿瘤的特效药,但是价格非常昂贵,在国内一个月的治疗需要2.5万RMB。我看在ud的这个项目中有类似的分子结构,我很想知道这些分子结构最后都给谁了?是不是有偿的?

如果最终的结果是卖给大企业了,那我们中国人是不是在给别人做嫁衣啊?

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发表于 2005-4-11 21:05  资料  短消息  加为好友 
这个问题在WCG的论坛上被反复讨论过了啊

WCG是承诺不进行商业利用的.

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Snake_SH
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发表于 2005-4-12 00:58  资料  短消息  加为好友  添加 Snake_SH 为MSN好友 通过MSN和 Snake_SH 交谈


QUOTE:
shjiaohan  在 2005-4-11 08:39 PM 发表:

我是在制药行业工作的,我发现在UD已经完成的cancer的项目中,有好几个分子是国外制药企业正在开发中的抗癌药物,怎么会这样?

另外洛氨酸激酶(PTK)极其相关的分子是目前很有潜力的一类药物,如:格列卫(洛氨 ...

请参考
UD应该引起大家的注意!






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发表于 2005-4-12 01:13  资料  短消息  加为好友  添加 Snake_SH 为MSN好友 通过MSN和 Snake_SH 交谈


QUOTE:
shjiaohan  在 2005-4-11 07:48 PM 发表:

都说了,我是小白啊!

我还有几个问题
1、ud、wcg和FAD的项目是互通的么?
2、计算出来的东东专利是老外的么?(是老外的,我就不参加了)
3、中国有这方面的计算项目么?

1. ud和wcg用的客户端程序除了图标完全一样。现阶段ud包含wcg的hpf项目,而wcg不包含ud的cancer项目。fad用的蛋白质解析程序是ud cancer项目第一阶段的think程序,但用下来hit太多换而言之就是目标太多,这对于药物筛选作用有限,所以牛津改用ligandfit程序进行二次筛选,这就有了cancer项目的第二阶段。 think不被ud使用后就自己搞了个fad,程序进行了改进对各种新的指令集进行了优化,运行速度有了很大的提高,但蛋白质解析算法有没有改进,我不太清楚。这个可以问算fad的朋友。基本上这3者关系就是这样的。
2. 看了“UD应该引起大家的注意!”就清楚了
3. 就我所知还没有。






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shjiaohan
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发表于 2005-4-12 10:31  资料  短消息  加为好友 
感觉好象是不同的方面

第一次计算偶米有参加,不过这次计算的都是连接蛋白的结构,好象和第一次不一样哦!

问题:
我发现我好象在重复计算同一批小分子连接蛋白(一共450个)或者是一个大分子连接蛋白被拆开来了?会出现反复计算同一项目的现象么?

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发表于 2005-4-12 11:59  资料  短消息  加为好友  添加 Snake_SH 为MSN好友 通过MSN和 Snake_SH 交谈
客户端计算量由服务器的管理员控制,450个ligand一定是大的拆开的。
至于计算哪个项目,要看你在ud网站是怎么设置profile的。如果是同时参加hpf和cancer的话,两个项目会自动交替运算的,无需人工干预。






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版主真是强!长见识了!





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http://www.statgfx.com
已经好几天没有更新了,再等等看吧。或者换个签名网站看看。
至于信用卡付钱什么的我不清楚,因为我一分钱都没有交过
不过可以为这个网站捐款,当然这是自愿性质的。






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