利用Linux脚本实现计划FAH任务数量

panzerkiller

原理：
利用脚本监视进程，当检测到进程中没有fah运行的时候自动启动；如果检测到fah程序已经运行，等待若干分钟再检测。
延伸：
可以建立一个joblist.lst文件来保存不同的启动命令，在命令中加入-oneunit参数，这样就可以有计划的跑不同的参数，比如像我，跑完一个bigadv大包想歇两天，每天只开半天跑smp2，joblist.lst可以预先编辑成
“
screen -d -m ./fah6 -local -smp 8 -bigadv -verbosity 9 -oneunit
screen -d -m ./fah6 -local -smp 7 -advmethods -verbosity 9 -oneunit
screen -d -m ./fah6 -local -smp 7 -advmethods -verbosity 9 -oneunit
screen -d -m ./fah6 -local -smp 7 -advmethods -verbosity 9 -oneunit
screen -d -m ./fah6 -local -smp 8 -bigadv -verbosity 9 -oneunit
（略）”

上code，本人非编程出身，遇到复杂情况没有啥技巧，哪位能用帮忙精简一下，感激不禁

#! /bin/bash
#The original code came from http://bbs.ustc.edu.cn/cgi/bbscon?bn=Linux&fn=M4B696189
sleep 600 #stop 10min to make sure the system is start-up well
list="/home/xxx/folding/joblist.lst" #File that contains submit-job commands
job=`head -n1 $list` #Load the first line
num_job=`less $list |wc -l`
job_exe="fah6"
num_cpu=1
rm -f joblist.tmp

while [ "$num_job" -ge 2 ]
do
        for ((i=0; i<1000; i++))
        do
                job_count=`ps -ef|grep $job_exe | grep -v "grep"|grep -v "SCREEN"|wc -l`

                while [ "$job_count" -ge "$num_cpu" ]
                do
                sleep 1800 # 如果当前有num_cpu个任务在运行的话，等1800秒再检查一次
                job_count=`ps -ef|grep $job_exe | grep -v "grep"|grep -v "SCREEN"|wc -l`
                echo $job_count         
                done
# 现在有CPU空闲了，运行一个任务
        pushd /home/xxx/folding/smp
        $job &
        echo `date`
        echo $job
        popd
# Remove the submitted job from joblist
        cp $list joblist.tmp; sed 1d joblist.tmp > $list ; rm -f joblist.tmp
        sleep 120
        job=`head -n1 $list` #Load the next line
        num_job=`less $list |wc -l`
        echo $num_job
        sleep 600 #Wait 10 minutes to make sure fah starts properly
done
done

cicikml

必须要顶你了，呵呵

eqzero

这个必须顶！

lin5

好贴，要顶得

金鹏

感谢兄弟分享经验

panzerkiller

晕～睡一宿觉才发现有bug，刚刚改过来，显示红字部分

zglloo

ps -ef|grep $job_exe | grep -v "grep"|grep -v "SCREEN"|wc -l

这些管道少用行吗？

panzerkiller

只要能抓出你要的进程就行，我只会grep+＂｜＂，所以搞得很复杂；这个脚本一定先试运行调试好了再跑fah，我当时调得被服务器认为机器不稳定，挂起２４hr；脚本可能还有小bug，脚本运行几个小时后，找不到这个脚本的进程，也不知道是循环到头了还是出错。

ps -ef|grep $job_exe | grep -v "grep"|grep -v "SCREEN"|wc -l

这些管道少用行吗？
zglloo 发表于 2010-4-26 20:02