|
|
本帖最后由 panzerkiller 于 2010-4-17 02:47 编辑
老生长谈了
无意中从equn.com链到mdbbs.org，进去逛了一圈，发现一个问题：论坛挺热闹，说明国内做分子动力学的研究人员，对计算量的需求很大；遗憾的是，没看到一篇贴子涉及分布式计算。与此同时，equn上大把的热心人在算FAH（斯坦福大学潘德研究小组的分布式计算项目，目前世界最大的项目）。于是，一个想法产生了：肥水不流外人田，给自己人算！
首先，对几个问题做一些简单分析
国内的研究人员为什么不用分布式计算？
a. 不知道分布式计算之存在
b. 知道，也了解运作方式，但因为某些原因不愿意采用
b1: 担心安全性，自己辛辛苦苦开发的课题，一行行写好的程序，万一被别人拿去发了paper，自己只有傻眼的份。
b2: 担心计算资源不稳定，因为程序的运行和调试需要大量的精力和时间，志愿计算这种可能连７x２４都没办法保证的方式，怎么让人放心？万一到期拿不出结果耽误事情，找谁？
b3: 家用机器太低端，不屑一用
以上这几点是我能想得出的原因，下面就来说说我的想法，为什么分布式计算可以用。
首先，安全问题不必太担心，以我的研究经历，你自己的数据，出了实验室，基本上没人能看懂；即使能够费尽周折反向了你的课题，也还要考虑一下费这么大劲偷别人课题值不值得；其实相对于自己课题被网络上某人偷去，你的第一作者被师兄／老板拿去的机会更大。
其次，来说说分布式计算的优点。
以我的理解，模拟计算，除了在乎计算速度，对结果的稳定性也有一定要求，通常都需要不少于两次的验算。所以评估一个模型的计算耗时应该把验算时间加进去。这时候，分布式计算的优势就显示出来了，简单算一笔小帐：
假设有一个程序，需要验算３次，
一台双CPU至强运行一次耗时２４小时；
一台单CPUi７运行一次耗时４８小时；
方案一
单独用一台双CPU至强，完成整套运算耗时２４x３=７２小时；
方案二
用双 CPU至强运算的同时，交给N台i７验算，这样，理想情况下，４８小时后，将得到N+１个结果，N＞２的话就算超额完成任务。
方案二的另一大优势是其天然的相对稳定性：即使在最不理想的情况下，如遇机器罢工，停电等人力不可抗拒之因素，方案一只能顺延耗时，方案二却能占概率的便宜，按时完成：毕竟全国停电的几率不是很大。
最后，方案二还有个非常诱人的优势：省钱. 这个对一些经费不充足的组还是有意义的，现在研究生的工资也要从老板经费里扣了
啰唆了这么多，相信各位跟我一样，一定在考虑同一个问题：怎么运作？我有一个大概的构思，在这里提出来，希望大家拍砖的同时，能够集思广益, 完善这个想法。
第一阶段，依托论坛，手动发包。（这里把需要计算资源的研究人员简称为雇主，志愿提供计算能力的叫短工）
雇主发贴招聘，说明计算需求－－－＞短工报名，展示机器配置，可运行情况－－＞雇主统计，邮件发包，或者干脆上论坛附件，随便下载－－＞。。。－－＞短工提交结果－－＞雇主发工资（伪币，评分，任意一种可满足虚荣心的方式）
第二阶段，在吸引足够多的眼球，雇主短工达到一定规模，反映良好的情况下，开始考虑搭建自动发包的服务器，可以直接用BOINC的，我就不多说了。
第三阶段， 有偿计算，这个太远了，暂不考虑。
这个构思中，第一阶段是其核心，就象电子商务一样，本质还是商业，网页啊，平台啊只是实现的手段。推广分布式计算，人气是第一位的，眼下在国内推广，上游研究人员的认同比我们下游志愿者的人数更重要。
以上这些，纯数闭门造车，希望大家指正 |
|
发表于 2010-4-17 02:45:28
发表于 2010-4-17 09:15:03
