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United Devices (UD) (寻找抗癌药物) 新手指南

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发表于 2004-7-28 00:00:00 | 显示全部楼层 |阅读模式
United Devices 项目精华文章索引
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United Devices (简称 UD )位于美国德克萨斯州奥斯汀市,是一家提供专业分布运算解决方案的公司。其分布运算解决方案的涉及范围甚广,包括生命科学、金融服务、工业制造、政府机构、科研机构、娱乐及媒体等等。就在 2004 年 1 月 7 日,UD 宣布在全世界有超过 200 个国家共计 2500 多万 CPU 加入而成为运行中的最大的分布运算平台。

当前 UD 上运行主要是针对癌症药物的研究,主要由牛津大学化学系、美国国家癌症研究基金会主持。研究结果将完全公开(需要指出的是这只是研制治疗癌症药品万里长征中的一步,但这无疑将加速整个研制过程。不管最后是谁制造出药品,这都将造福全人类)。

Founded in 1999, United Devices is the market leader in secure grid solutions for any size business and has delivered scaleable, secure, successful deployments in heterogeneous environments in a variety of industries. United Devices offers comprehensive distributed computing software and services to build enterprise grids from existing compute resources.

官方网站:http://www.ud.comhttp://www.grid.org/home.htm
中文站点:http://www.equn.com/udgrid/
客户端下载页面:http://www.equn.com/udgrid/download.html
最新版客户端下载地址:http://download.ud.com/gold/win32/ud_agent_setup.exe (大小:1.566 MB)
本站下载:http://www.equn.com/udgrid/ud_agent_setup.exe
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UD 新手指南
http://www.equn.com/forum/viewthread.php?tid=1084

UD 客户端界面各区域内容详细解说
http://www.equn.com/forum/viewthread.php?tid=10192

【原创】如何使用 United Devices (不断更新中)
http://www.equn.com/forum/viewthread.php?tid=769

UD 计算截屏图片欣赏
http://www.equn.com/forum/viewthread.php?tid=54

UD 中国的统计
http://www.equn.com/forum/viewthread.php?tid=55

怎么算 UD 呀?
http://www.equn.com/forum/viewthread.php?tid=298

UDMonitor 使用方法详解
http://www.equn.com/forum/viewthread.php?tid=11681

UD 个人签名图片制作
http://www.equn.com/forum/viewthread.php?tid=7919 (现在图片引用需要认证,所以不推荐大家使用该帖提供的签名网站,2006年2月4日补充说明)
http://www.equn.com/forum/viewthread.php?tid=11654 (强烈推荐)
http://www.equn.com/forum/viewthread.php?tid=11719  (推荐)
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 楼主| 发表于 2005-11-6 14:33:35 | 显示全部楼层

一些必要的说明

如何加入小组?

推荐加入“CHINA”小组,是目前人数最多的一个中国人创建的小组,请到 https://www.grid.org/services/profile.htm 页面登陆,然后将个人资料中“Country”处选为“CHINA”,点击“SAVE”保存,然后点击页面 http://www.grid.org/services/tea ... 4-932A-C6688CEABFC7 ,进入后点击“JOIN THIS TEAM”,就可以加入中国人数最多的小组了。

其它一些新手有必要知道的问题:

1、如果要详细了解 UD 可以访问项目官方站点:http://www.grid.org/home.htm
中文翻译:http://www.equn.com/udgrid/

2、UD 是美国联合设备公司(United Devices)的缩写,该公司开放了一个分布式计算平台,名为 Grid.org,该平台目前主要针对癌症(或者说肿瘤)进行一系列的研究。

3、关于 UD 癌症项目的详细情况,可以通过如下页面了解:
http://www.equn.com/distributed/ap-lsciences.html (中文)
http://www.equn.com/distributed/platforms.html (中文)
http://www.equn.com/udgrid/cancer.html (英文)

4、UD 主要是针对某些特殊的蛋白质进行研究,用以寻找能够对抗某些特定器官癌变的有效药物。

5、您所有需要做的事情,仅仅只是下载一个客户端软件,然后安装运行,就可以了!

6、软件下载地址:http://download.ud.com/gold/win32/ud_agent_setup.exe

7、软件使用说明:http://www.equn.com/forum/viewthread.php?tid=2740

8、软件运行过程中,您无须对程序做任何事情,但是在程序自动连接到服务器下载计算任务和上传计算结果的时候必须正常联网。

9、个人的计算结果可以到官方用户服务页面登陆查询:https://www.grid.org/services/home.htm

10、国家统计页面:http://www.grid.org/stats/geos/c ... y/country.htm?cc=CN 。个人统计请到 https://www.grid.org/services/home.htm 登陆,可以看个人统计。点击 http://www.grid.org/services/tea ... 4-932A-C6688CEABFC7 可以看“CHINA”小组统计。

11、WCG 客户端与 UD 客户端不可共存,WCG 是 IBM 主持的,但是使用 United Devices 开发的核心程序。

12、UD 项目是由英国国家癌症研究基金资助的,由牛津大学化学系计算药物发现中心主持,用来寻找新型抗癌化合物。这个项目于2001年4月启动。该项目要筛选 35 亿个分子,包括 16 个与癌症治疗有关的蛋白质。该项目第一阶段使用了 THINK 软件,该软件利用药效基团进行完全构象检索,和其它虚拟筛选软件类似,THINK 也使用由 Proteus 公司开发的 ChemScore 对命中率进行等级排列。该项目使用的是 THINK 简化版本,占用客户端的内存较少,因此可以允许更多的个人计算机参与筛选工作。该项目最初对有 23 个组合化学库的 3500 万个分子进行筛选,这些分子已经进行了过滤,将不符合药物特性的分子去掉,然后依据一定的算法将这 3500 万个分子衍生为 35 亿个分子组成的虚拟化合物库。目前该项目第一阶段的工作已经完成。从2002年7月1日起进入了第二阶段的工作。第二阶段使用 LigandFit 软件,筛选的效率可以进一步提高。

13、从 2005 年下半年起,UD 有时也帮助 WCG 处理部分 HPF 任务,所以 HPF 也可看做是运行在 UD 下的子项目。
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发表于 2007-4-26 15:41:58 | 显示全部楼层
项目在2007年4月27日中午12:00时,结束长达7年的分布式计算。

其他有志参与分布式计算,或者UD的计算会员,欢迎转换到其他的分布式计算,如D2OL,Distributed.net等继续分布式计算,延续UD的精神。

或者参与World Community Grid,继续适用熟悉UD的界面。

参见新闻:http://www.equn.com/forum/thread-10139-10-1.html

[ 本帖最后由 静思夜 于 2007-4-26 15:43 编辑 ]
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 楼主| 发表于 2007-4-27 20:51:40 | 显示全部楼层
本帖取消置顶。
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发表于 2007-4-27 21:14:56 | 显示全部楼层
UD结束了  但是癌症希望 能在我们的计算力下解决他   继续WCG
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