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大家好,我是CAS@home项目的新的管理人员。我刚才浏览了大家的帖子,觉得非常抱歉,没有及时将CAS@home项目的最新状态更新,反馈给广大热心的中国志愿者们。
在过去的几个月里,我们经历了人员的变动和项目的交接(项目原来的管理人员wujie去法国了),因此许多工作被延后了。对此,我再次表示歉意。
在这期间,我们主要在做三件事情:
1. 将“清水计算”的应用程序LAMMPS移植到CAS@home平台上。LAMMPS是一个通用的用于动态分子模拟的软件,移植成功后,除“清水计算”项目外的其他项目也会在使用该应用程序在CAS@home平台上运行他们的计算任务。目前,我们已经在Linux平台上成功移植了LAMMPS,正在进行Windows和Macbook平台的移植工作。预计,清水计算将在2012年的1月份正式发布。
2. 将高能物理模拟和分析软件BOSS移植到CAS@home平台。BOSS是专用于北京谱仪的物理模拟和分析软件(北京谱仪是位于中国大型高能物理实验装置北京正负电子对撞机的上一个探测头,用于捕捉正负电子高速加速对撞后产生的各种光、电信号)。目前来自世界各地的物理学家参与到了该实验,期望在3.5Gev的能区找到新的微观粒子,更新人类对微观世界的认知。BOSS软件系统复杂庞大,目前只能运行在Linux平台上,因此我们将借助虚拟机技术,使得BOSS能运行在通用的平台上。由于目前BOINC与虚拟机结合还存在一些技术问题,我们正在与伯克利大学的开发人员一起调试,解决这些bug(我们的技术路线与LHC@home有所不同,因此CAS@home是目前第一个直接使用BOINC与虚拟机技术结合的项目),因此该项目的具体发布时间还需要待定。
3. 我们正在进行CAS@home网站的改版工作,期望网站能够为志愿者提供更直观,有用的信息。新的网站将在2012年1月正式发布。
此外,关于CAS@home这个项目的一点解释:
CAS@home是由高能物理所的计算中心发起和组织的项目,该项目的目的是通过CAS@home平台汇集大家贡献的计算资源,提供给中国科学院以及其他研究机构的科学家们使用。目前平台上正式运行的一个应用是来自中科院计算所的蛋白质结构预测项目(SCThread),该项目主要是通过模板比对的方式,来预测新的蛋白质的结构,帮助人类从分子水平认知生命过程。
最后,非常感谢各位志愿者的热忱支持和意见反馈,今后,我们会更多地通过“中国分布式计算论坛”这个平台与大家进行交流!
更新:
对于BOSS软件,即使志愿者本身的机器是linux机器,也需要使用虚拟机技术,因为和所有高能物理分析软件一样,这个软件的结构、安装、配置太复杂。
我们只能采取将软件通过共享文件系统进行分发,然后通过预装在虚拟机镜像里头的客户端访问这些软件包。这个应用对志愿者的磁盘和网络带宽 要求比较高(至少10G的硬盘空间,需要下载的文件大约为1GB,如果满足这些条件的志愿者届时可以尝试一下)。我们当前的目标是针对在IHEP的园区范围内志愿计算机。
LAMMPS虽然linux测试已经通过,但是关于作业的许多细节工作还需要和清华大学的项目人员商量、确定。 |
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