给大家推荐一个感觉不错的组合

金鹏 · 发表于 2012-1-31 19:21:25

回复 26# hmaimi

8路平台加上散热和硬盘及主板本身耗电，没个1千瓦是拿不下来了的，而且MEB主板+扩展板想找个舒服的地方放置也是问题，但从购置的角度PPD/元来讲的确是个不错选择，考虑其他综合因素，感觉还是。。。。

金鹏 · 发表于 2012-1-31 19:25:20

回复 27# cuda

4路170K与期望值相差很大，配置维护摆放都不是简单的事情，性价比没问题。

双路ES 56XX整个ATX主板随便一个机箱虽说性价比不高，但是要简单省事多了，也有120K上下的PPD

金鹏 · 发表于 2012-1-31 19:32:20

回复 29# hmaimi

这个方案是个不错的选择方案，但我感觉不是最佳的，
如果B16期限不缩短一半，那么方案1是不二的首选，
先观望斯坦福对BA12 BA16期限的限制程度了。

PS: O版即将建成的4*6272推土机平台也是一个相对均衡的方案

futurescz · 发表于 2012-1-31 21:17:12

有没有集群性质的方案？比如3台2600K能不能集群成12C24T的主机？

wpf999 · 发表于 2012-1-31 22:27:05

回复 34# futurescz

很遗憾，没有这种解决方案

hmaimi · 发表于 2012-1-31 22:35:17

回复 futurescz

很遗憾，没有这种解决方案
wpf999 发表于 2012-1-31 22:27

其实是有滴~ 不过限制较多，而且一般个人貌似搞不到，只针对大型机构

nekoko · 发表于 2012-1-31 23:28:22

回复 36# hmaimi

是真的没有~~除非使用MPI库对计算程序重新编译，斯坦福可不让这么干

cuda · 发表于 2012-2-1 11:36:10

本帖最后由 cuda 于 2012-2-2 20:55 编辑

用集群模拟单机跑bigadv目前还没看到有人成功。不过我觉得现在很热门的"The Kraken wrapper"给我们提供了一种可能的思路。这个外挂程序可以大幅提高多路系统的fah并行效率，其主要原理是利用ptrace来跟踪控制线程。ptrace非常强大，理论上可以操控线程的一切。thekraken主要是用它来截获fah线程的signal并设置fah线程的cpu affinity，实现优化的线程CPU分配。原则上讲，如果更进一步把线程迁移到另一台机器上也不是不可能，但是需要修改Linux内核，难度很大。并且即使真的可行，在传输带宽、延迟方面的要求也会很高。一般的千兆网估计达不到要求，但infiniband应该可以。

wpf999 · 发表于 2012-2-1 13:38:52

回复 37# nekoko

貌似允许写fah客户端的插件：http://folding.stanford.edu/English/FAQ-OpenSource

要不然等我有空时写个MPICH多主机计算的插件？

cuda · 发表于 2012-2-1 13:58:02

那个页面Last Updated on February 03, 2010，2年没更新了。现在fah早已不用MPICH，要做多机插件很有难度啊。

回复 39# wpf999

wpf999 · 发表于 2012-2-1 14:43:28

回复 40# cuda

windows版本SMP没有用MPI了，linux下的SMP还是在用MPI：http://folding.stanford.edu/English/LinSMPGuide

cuda · 发表于 2012-2-1 16:13:34

本帖最后由 cuda 于 2012-2-1 16:15 编辑

文中提到的"MPI layer"指的是什么我也有些困惑。不过可以肯定的是目前的SMP客户端使用的是原生的多线程模式，线程之间的通讯没有通过网络，现在用的我估计是CLONE_VM共享内存来通讯。
这个可以通过lo设备的流量的变化看出来，以前MPICH方式的时候lo有巨大的流量，现在则完全没有了。前两年的确是有人成功地在mosix上跑fah的，但现在是不行了。

回复 41# wpf999

hmaimi · 发表于 2012-2-1 16:23:42

回复 hmaimi

是真的没有~~除非使用MPI库对计算程序重新编译，斯坦福可不让这么干 ...
nekoko 发表于 2012-1-31 23:28

ScaleMP公司就是专门将多台服务器合并的软件公司
针对高性能计算的软件，每个节点要价1700美元除此之外还有各种各样的费用
找了半天没找到这个东西的详细说明。。。。

cuda · 发表于 2012-2-1 16:41:15

这个恐怕要有源代码重新编译才行吧？

wpf999 · 发表于 2012-2-1 18:23:34

回复 43# hmaimi

求链接

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