Folding@Home使用说明 (图形界面 4.0 版)

Simon_Sen

简介Folding@home是一个研究蛋白质折叠，误解，聚合及由此引起的相关疾病的分布式计算工程。我们使用联网式的计算方式和大量的分布式计算能力来模拟蛋白质折叠的过程，并指引我们近期对由折叠引起的疾病的一系列研究。

详细-----http://www.equn.com/folding/

下载页面http://www.equn.com/folding/download.htm
建议用windows图形版的!!!

直接下载链接-------http://www.stanford.edu/group/pandegroup/[email protected]

装好后, 看下图设置!!

进入高级设置：
设置用户名(user) 和 参与队伍编号(teamnumber) ，队伍编号请填写：3213



网络设置:不是拨号上网的和不需要代理的可以跳过, 按默认设置!!

Simon_Sen

图形界面DIY,  打造自己喜欢的....
图形刷新率会增加 cpu的占用率(虽然是一点点, 但推荐图中的设置, 除非你为了欣赏 图形.....)


一般上大家主要设好 用户名(user) 和 参与队伍编号(teamnumber) 就行, 日常使用上不用理会, 只要经常打开让它运行就行!!! 要进一步优化调整的看以下高级设定图解教程!!而高级设定也不太复杂, 有详细的图解说明!!



对于命令行版本，请参见：一些folding@home心得。
感谢phoen8x朋友提供！      
http://www.equn.com/forum/viewthread.php?tid=1916

如果想使用支持HT技术的CPU开多个F@H，则必须至少有一个命令行版！

如果有HT，一个命令行版，这样他们的电脑一直会有50%load，然后用图形版当屏保。或者直接装2个指令版的service。

如果不能发送结果包，fah4console会自动重试。先是每2分钟一次，几次失败以后，它会试着下载新的wu。然后每6小时重新尝试连接一次发送结果。


如果有可能的话尽量用ntfs,不要用fat/fat32。因为如果当机的话fat/fat32会掉包。windows xp 可以把fat/fat32转换成ntfs。方法是：运行convert c: /fs:ntfs。需要重新开机。

在win2000/xp下走用service最好。

强烈推荐一个非常好用的命令行版安装包！可以去这儿下载：
http://project-2501.net/files/FA ... Installer.v0.32.exe

用法如下：

作点说明：
-forceasm ：强迫使用最优化的assemble代码。一般来说Intel的芯片会默认用SSE/SSE2,AMD的如果用-forcesse也会用sse代码。有时候电脑不稳定，会当机。重新开启后FAH会停止使用SSE。-forceasm告诉FAH一定要用sse。
以前因为Fahcore_78有bug，会导致用sse时芯片过热而当机，现在已经没有了，所以是基本无用。

可以通过“开始”--“运行”--“cmd”(xp系统)（或“command”9x/2000/Me系统）--然后进入“FAH4Console.exe”所在的文件夹--运行“fah4console -configonly”更改设置。

如果你改过fah4console.exe，你会发现一些没有公布的switches。
比如：-betateam -internal -delete 等。
-betateam 会给你beta wu，听说很不稳定，比advmethods差很多。


其他命令行版配置说明请参看本贴第6楼文字

和平

最新的教程,非常好!~~~~辛苦了

SimonSen

关于folding@home的几点补充说明,
严重提醒:使用nvidia显卡的f@h用户要注意了, 在图形版上会和nv的驱动发生openGL冲突而发生死机等情况, (绘图用的是ogl加速), 建议使用53.xx或者以上的whql驱动, 最好不要用beta版驱动, 而目前在ATI的各催化剂版本上都没有发现什么情况!!!
另一个解决方法是不用图形版, 使用windows的console(dos)的客户端!!!
欢迎大家把使用中的情况在论坛发贴反映!!!


鉴于folding@home在代码优化上, sse比3dnow 差不多快一倍!!
所以建议 amd的Athlon XP, 新Duron用户使用-forceSSE 参数强制进行sse优化(具体方法看图), 因为鉴于目前出错的几率比较小, 而使用sse参数后比3dnow 的运算速度快差不多一倍,
利>>>>>弊.(thunderbird旧核心出错机会比较高, 请权衡使用) 但对于400的wu无效, 因为400的wu 用的运算内核不支持任何优化, 只用最原始的浮点运算!!

[此贴子已经被作者于2004-3-16 6:14:52编辑过]

SimonSen

关于图形版 和 windows的console(dos)版本!!
两者从本质上并无区别, 因为两者其实都是一个shell, 都是基于共同的运算核心!! 所以计算的效率差不多!!
而图形版 因为支持opengl加速, 消耗的cpu资源可以忽略不算, 但也建议关闭图形界面, 让它最小化, 让cpu资源都集中在计算上!!

关于Folding@home 和 Genome@home!!!(出自官方中文网FAQ)
Folding@Home和Genome@Home

什么是Genome@Home？它与Folding@Home项目和Folding@Home科研有什么关系？
Genome@Home是斯坦福大学Pande实验室的另一个分布式计算项目。 您能在http://genomeathome.stanford.edu上看到更多详细资料，但简要地说，Genome@Home的目标是蛋白质设计和它的应用。 我们设计蛋白质的一个主要应用就是创建设计蛋白质序列的大资料库，实际上是“再设计” 或“反编译” 一条现有的染色体(因此命名"Genome@Home") 。
蛋白质设计的另一个应用是将了解蛋白质为什么折叠，他们为什么会“误折”和聚合。 这是Folding@Home的一个主要问题，与我们的对于蛋白质折叠和“误折”的研究有直接地联系，事实上它与“误解”相关的疾病也有关，譬如阿兹海默症、肌萎缩性脊髓侧索硬化症等等。回顶

我怎样能选择F@H 或G@H ，要设置一下，还是让客户自动选择？
我们客户端很有灵活性。 特别是：其一，只想要参与其中的一个项目；其二，想要同时参加两个计划但是在计算机资源分配等问题上选择一个优先项目；其三，想要把计算量贡献给当时最需要帮助的项目。因此，客户端是可选择的。如果您选择了一个G@H组，您将参加G@H。如果您有偏爱其中的一个，那么您可以在客户端里选择您喜欢的那个。如果您不在意，可以保留默认值。如果您选择了一个项目(例如G@H)却得到了另一个项目的数据，那肯定是出错了，我们将设法修正它。 我们知道这很重要。 长期以来我们一直在设法合并我们的这两个项目的程序框架以便简化服务器端的工作，并让我们更灵活地进行科学研究。 我们了解统计的重要性，并按如上所述的一直在进行不懈努力。
这里要特别说明的是，如果您打开了“advmethods（Advance Methods, 高级方法）”选项，得到了我们的最新的解码程序和数据包，这将忽略您的所有选择设置。回顶

为什么合并二个项目的客户端程序？
尽管我们的项目属于生物科学范畴，但是既然我们在用分布式计算来实现就一定离不开分布式计算的科学。我喜欢让我的小组把时间投入到科学上，而不是管理一个分布式计算系统。如果用一段基础程序实现两个项目，而不是两段完全不同的程序，这将简化了我们的工作，因此合并他们。这将使我的小组能够集中精力搞科学研究。回顶

这里有官方详细的中文FAQ疑难解答!!====
http://www.equn.com/folding/faq.htm

alen

写的不好不对的还请大家帮更正.

推荐用的参数:如果是intel 支持SSE的CPU(Celeron 2后的CPU)可以去掉 -forcesse, Intel / AMD 不支持SSE的CPU也要去掉.(如Celeron I / 旧Duron).
FAH4Console.exe -local -forceasm -forcesse -advmethods

第一次运行F@H时会有具体的配置问题出现, 看图:



点击看大图:




用快捷方式来运行F@H:




注意,此贴介绍只适用于F@H 4.0命令行版.

[ Last edited by alen on 2006-6-18 at 23:23 ]

alen

[B] Simon_Sen [/B] 最好把你那篇使用支持HT技术的CPU开多个F@H的文章也帖过来, 这样就全了, Gzeasy现在不能匿名访问了, 你原来的帖子: http://bbs.gzeasy.com/index.php?showtopic=90578

花泥

请版主重做一个两个CONSOLE版同时运行的教程啊

我现在用一个5.02,一个4.0 CONSOLE,装好了就是服务的
一开始一切正常,后来出过一次错后问题不断,有3个WU算完了不上传,有几次莫名其妙同时开了两至三个FAHCORE78也就是GUI版,致使进度始终不动,还有其他什么的,受不了了啊,我要换两个CONSOLE

碧城仙

LCL121做的教程，欢迎大家下载：
http://www.equn.com/folding/guide.chm

fulcrum1983

真狠自己怎么没早点看到这个教程！

碧城仙

推荐使用 Folding@home 的命令行版本：FAH502-Console.exe 。
下载地址：http://www.stanford.edu/group/pa ... /FAH502-Console.exe

下载完毕后，第一次运行 FAH502-Console.exe 将出现配置向导，以下英文部分是直接拷贝配置说明，每个设置项后面的中文说明系本人添加，如果错误，欢迎指正，谢谢！

use of this software requires that you have read and accepted this agreement.

No directory settings found in registry. Using current directory...


--- Opening Log file [March 13 14:16:25]


# Windows Console Edition #####################################################
###############################################################################

                       Folding@Home Client Version 5.02

                          http://folding.stanford.edu

###############################################################################
###############################################################################

Launch directory: E:\丁聪\Folding@home
Executable: E:\丁聪\Folding@home\FAH502-Console.exe


[14:16:25] Configuring Folding@Home...

客户端配置开始。

User name [Anonymous]? Ding_Cong

在问号后面填入您打算使用的 userID（用户名），只能使用英文字母（大小写）、数字、部分符号，参加该项目不需要到官方网站上去特意的注册，仅仅只需填写用户名和小组编号就可以了，但是最好到官方论坛上去查一下自己的用户名有没有和别人重复，否则就是帮别人算了。查看地址：http://folding.stanford.edu/download.html ，上面的“Ding_Cong”是本人的用户名。

Team Number [0]? 3213

在问号后面填入您打算加入的小组的编号，欢迎加入中国小组，其编号为“3213”。当然，您也可以选择参加其他的小组或者什么小组都不参加。

Launch automatically at machine startup, installing this as a service (yes/no) [no]? yes

此项设置用来询问您打算以何种方式运行客户端程序，您可以在问号后面填写“yes”将客户端程序设置为系统服务进程，从而达到客户端程序随开机过程自启动的目的。强烈推荐您填写“yes”，因为这样做还有一个好处，就是能够隐藏客户端程序在系统托盘上的小图标，从而使得客户端程序不易被不了解分布式计算的人误关闭。

The program will continue in non-service mode now, working in E:\丁聪\Folding@home.
The next time the computer is starts up, you should see work automatically continue there. Note that when this service is running, you should not try to manually run F@H from that directory at the same time.

Ask before fetching/sending work (no/yes) [no]?

是否要在下载或上传计算任务包前提示您？如果您是拨号用户，建议填写“yes”；如果您是宽带用户，建议填写“no”。

Use Internet Explorer Settings (no/yes) [no]? yes

是否使用 IE 的联网设置？就是说客户端程序可以直接使用和 IE 一样的代理服务器设置。如果您访问国外的网站需要设置代理，建议填写“yes”；如果您能够直接访问国外的网站，建议填写“no”。

Allow receipt of work assignments and return of work results greater than 5MB in size (such work units may have large memory demands) (no/yes) [no]?

是否允许接受大小上超过 5MB 的任务包（显而易见的，计算过程中您的内存消耗会增大一些）？普通用户建议填写“no”；如果您的内存足够大、CPU足够强劲、网速足够快，可以选择填写“yes”。

Change advanced options (yes/no) [no]? yes

是否要修改高级设置？建议普通用户填写“no”；如果您要调节您的 CPU 的使用率或者想有些其他比较个性的设置，请填写“yes”。
如果填写“no”，那么以下的内容不会出现。

Core Priority (idle/low) [idle]? low

设置客户端程序运行的优先级，“low”是用最底优先级运行。“idle”是使用空闲的 CPU 资源运行。您自己做决断吧......

CPU usage requested (5-100) [100]? 90

设置客户端程序运行时的最高 CPU 占用率，可以在5~100之间任意填写，如果您的 CPU 散热器不能支持长时间高温，我们建议 CPU 使用率不要超过 80% ，当然，您也可以填写“100”。

Disable highly optimized assembly code (no/yes) [no]?

是否关闭 SSE/3D NOW！优化代码？一般不关闭，关闭后计算速度会慢很多。推荐填写“no”。

Pause if battery power is being used (useful for laptops) (no/yes) [no]?

如果您是使用手提电脑参加本项目的，您可以选择是否在笔记本电脑未使用外接电源时依然参与计算。

Interval, in minutes, between checkpoints (3-30) [15]? 3

隔多长时间保存一次运算进度？如果您不能长时间计算，推荐填写“3”，单位是分钟。

Request work units without deadlines (no-pref/no/yes) [no-pref]?

是否设置请求下载任务单元的期限？推荐填写“no-pref”。

Ignore any deadline information (mainly useful if system clock frequently has errors) (no/yes) [no]?

是否忽略任务过期时间，一般不忽略，除非系统时钟不准或者 CMOS 经常掉电。

Machine ID (1-8) [1]?

设置机器编号，如果您在许多台计算机上安装本客户端程序，可以使用同一编号，即默认的“1”；如果您的 CPU 支持超线程（HT）技术，或者您的计算机是多 CPU 的，那么您可以在不同的文件夹下安装多个客户端程序，但是每个客户端程序要设置不同的编号。

到这里，所有设置均以完成，客户端程序将开始运行，并下载计算内核程序和计算任务包：

[14:18:38] - Ask before connecting: No
[14:18:38] - Use IE connection settings: Yes
[14:18:38] - User name: Ding_Cong (Team 3213)
[14:18:38] - User ID: 5DE712387036A8C4
[14:18:38] - Machine ID: 1
[14:18:38]
[14:18:38] Work directory not found. Creating...
[14:18:38] Could not open work queue, generating new queue...
[14:18:38] + Benchmarking ...
[14:18:42] - Preparing to get new work unit...
[14:18:42] + Attempting to get work packet
[14:18:42] - Connecting to assignment server
[14:18:47] - Successful: assigned to (171.64.122.143).
[14:19:01] + News From Folding@Home: Welcome to Folding@Home
[14:19:01] Loaded queue successfully.
[14:19:15] + Closed connections
[14:19:15]
[14:19:15] + Processing work unit
[14:19:15] Core required: FahCore_65.exe
[14:19:15] Core not found.
[14:19:15] - Core is not present or corrupted.
[14:19:15] - Attempting to download new core...
[14:19:15] + Downloading new core: FahCore_65.exe

......以下内容省略.......


设置完毕之后，在客户端程序所在的文件夹下将产生一个配置文件“client.cfg”，您可以通过文字编辑软件（例如：记事本）打开查看或修改，我的配置文件内容如下：

[settings]
username=Ding_Cong
team=3213
asknet=no
machineid=1

[http]
active=no
host=localhost
port=8080
usereg=yes

[core]
priority=96
cpuusage=90
checkpoint=3


或者您可以通过运行“FAH502-Console.exe -config”来重新进行配置。

Jackie8022

相当好的教程新手的我已经会了一大半，谢谢搂主了！！！

cn0923

慢慢看，呵呵

碧城仙

引用 跨越地平线 在 2005-9-11 21:21 时的帖子:
救命啊~我的Folding@Home图形界面安装不了啦~这是怎么一会事啊？

那就换个项目参加吧......不要吊死在一棵树上....