Untitled Document

CDC和其它实验室的科学家在SARS患者身上查出了未知的冠状病毒。新冠状病毒被认为是SARS的主要起因，其它病毒作为潜在的起因仍然处于调查之中。

冠状病毒当在显微镜下观看时是一组有晕圈或冠状物的病毒。这些病毒一般会导致人类轻微至中度的上呼吸道疾病，导致动物的呼吸，肠道，肝脏和泌尿系统疾病。冠状病毒在普通环境中只能存活三个小时。

SARS是最近在亚洲，北美洲和欧洲出现的呼吸疾病。病症开始通常是发烧(测量温度大于100.4°F[>38.0°C])。发烧有时同冷颤或其它症状联系在一起，包括头疼，身体不适和身体疼痛。某些人在最初表现出轻微的呼吸疾病症状。

在2到7天后，SARS患者会感到口干，干咳或血液供氧不足。在10%到20%的病例中，患者需要使用呼吸器。

SARS的主要传播方式是飞沫传播；当SARS患者咳嗽或打喷嚏使飞沫进入空气，别人吸入他们时就会感染。SARS也可能通过空气或接触传播。

目标 - SARS 目标 I TGEV 3CL-PRO

新病毒有50-60%是从三个已知的冠状病毒类分支出来的。由于冠状病毒的变异性很强，科学家为D2OL选择了一个能在易感人群和动物间传播的冠状病毒蛋白质目标。三维结构表示它实际上对主要"序列"有抗性，因此"SARS目标1"预计有广谱抗性。

几种疗养法已被用于SARS患者，但至今没有足够的信息能够证明他们有用。

SARS目标I

D2OL目标是在冠状病毒的传播生命周期中选择出具有抗性的药物viralcydal(滤过性毒菌)。

在您的帮助下我们测试那些可欣然接受的化合物，可信的"命中"药物可能在患病的细胞和动物模型上进行测试以确定对人体潜在有效。

冠状病毒主蛋白酶的结构看起来像糜蛋白酶一个额外α-螺线肌安宁的折叠的组合

Kanchan Anand, Gottfried J. Palm, Jeroen R. Mesters, Stuart G. Siddell¹,John Ziebur¹,
and Rold Hilgenfeld *
Department of Structural Biology and Crystallography Institute of Molecular Biotechnology, D-07745 Jena ¹Institute of Virology and Immunology, University of Würzburg, D-97078, Würtzburg, Germany

目标 - SARS目标II SARS/CoV 3CL-PRO

我们在4个星期前发布了我们的SARS目标，大家想了解更多关于我们选择的目标的信息，它怎么影响SARS这个特殊目标直至防止它传染。下面给出一个简单的解释。

SARS病毒是冠状病毒(在显微镜下，他们看起来像佩带着王冠)家族的一员。在某种程度上，所有冠状病毒都是相关的。尽管如此，科学家仍在试图了解SARS病毒的复杂多样性，实际上科学家已经研究其它7种已知的冠状病毒了近30多年。多年来，科学家已经得知冠状病毒在生命周期的方方面面都和冠状病毒家族的成员是一样的。因此，当我们在4个星期前知晓了SARS病毒是冠状病毒，我们仍不完全了解冠状病毒更不用说SARS了。这就是我们要做的。

SARS 目标II

D2OL目标是在冠状病毒的传播生命周期中选择出具有抗性的药物viralcydal(滤过性毒菌)。

所有的冠状病毒都产生一种名为"冠状病毒主蛋白酶"简称3CL-PRO的蛋白质。病毒把这种蛋白质用于自身复制和传播传染，因此使这蛋白质停止工作很可能会杀灭病毒。按药物研发观点这种蛋白质是非常吸引人的。制药公司已经知道怎样制作抑止病毒产生蛋白酶的药物(如，ritonavir和indinavir是抗HIV药物的主要成分)。Agouron的Pfizer部门已经成功研制出了病毒中引发感冒的3CL-PRO(鼻病毒)的蛋白质的药物。因此，冠状病毒主蛋白酶是治疗SARS的一个完美药物目标，这就是我们为什么在4个星期前选择了这个目标。

许多技术人员已经知道，准备让药物目标在计算环境里工作，首要的是解出它的X-射线晶体结构。这项工作由专业生物物理学家在工业或学术实验室完成。为了使D2OL能寻找药物抗3CL-PRO药物，我们需要确定蛋白质相应的X-射线晶体结构。四个星期前，(SARS病毒被确定之前)我们非常幸运的发现在德国的工作小组，已有几年历史，绘制出了导致猪腹泻的冠状病毒(传染性肠炎病毒,TGEV)的3CL-PRO的X-射线晶体结构。如上所述，所有冠状病毒的结构都非常相似，因为3CL-PRO是使冠状病毒正常工作的根本，所以我们假定不同的冠状病毒家族成员的3CL-PRO结构可能非常相似。我们有一些德国小组在他们的2001年的研究工作的证据，表明他们所研究的所有7种冠状病毒的3CL-PRO蛋白质的关键部分都是相同的。我们因而提交了从猪冠状病毒TGEV中提取的3CL-PRO作为目标，帮助我们寻找抗SARS药物。昨天，那个早先从事TGEV结构研究的德国小组在《科学》杂志发表文章(如果您这里发表文章，您会成功，并成为明星)声称他们解出了导致许多人的感冒的冠状病毒的3CL-PRO的结构(a.k.a. HCo-V)，根据这个和TGEV的结构，他们推导出了SARS冠状病毒的3CL-PRO结构。他们的结论如下:

1.正如前面我们的假定，3CL-PRO(使冠状病毒正常运作的部分)的核心与所有其它冠状病毒基本相同，对其中一种有效的药物应该对其它所有的都有效。

2.根据目前Agouron科学家完成的工作，德国小组认为，3CL-PRO会是防治SARS的一个重要的目标。

但我们在4个星期前全都已经知道了。

首要的是，在Rothberg研究院，我们是科学家。既然我们在为寻找正确的目标3CL-PRO上花费了大量的时间，我们正在非常仔细地研究德国小组的科学报告，并用它帮助我们尽快实施行动计划。在下面相关的部分将提供细节信息。

冠状病毒主蛋白酶(3CL^pro)结构:设计抗SARS药物的依据
 Sciencexpress
Kanchan Anand,^1,2 Jonh Ziebur,³ Parvesh Wadhwani³, Jeroen R. Mesters,^1,2 Rolf Hilgenfeld^1,2*
¹Institute of Biochemistry, University Of Lübeck, D-23538 Lübeck, Germany.
²Institute of Molecular Biotechnology, D-07745 Jena, Germany.
³Institute of Virology and Immunology, University of Würzeburg, D-97078 Würzburg, Germany
⁴Institute of Molecular Biology, University of Jena, D-07745 Jena, Germany

我们感谢作者在公开发布前给我们的实验室提供晶体结构。

目标 - SARS目标III

这项研究的第三个目标是HCo-V人造鼻病毒的3CL-PRO。由这个结构形成了SARS 3CL-PRO同源结构的理论(SARS 目标II)由德国小组发布。由于与SARS 3CL-PRO的相似性我们对这个结构的最有效候选药物非常感兴趣。我们相信由晶体结构得出的结果比由同源结构得出的结构更可靠。实际的测试结果将证实所有为SARS 3CL-PRO建立的模型的有效性。

SARS目标III

目标 - SARS 目标IV

如同我提及的，Agouron的科学家已经在感冒病毒(鼻病毒)3CL-PRO上做了大量的工作，甚至已经做出了对它有效的药物。所有这些都被出版在了科学文献上面。我们想利用他们的成果来帮助我们。首先，我们将放出第4个目标，同Agouron所研究的一样的鼻病毒3CL-PRO。因此当大家计算时看到这个目标请不要奇怪。我们同样放出了Agouron发布的那些对鼻病毒3CL-PRO有效的所有化学制品，与我们已经有的候选药物混在一起。然后我们会观察我们的计算机能否把Agouron的分子作为鼻病毒3CL-PRO的有效候选药物找出来(它应该如此)。如果对了，我们可以确信，我们的程序可以为3CL-PRO找到好的目标。如果我们得到的比最佳的结果还少，我们在职的计算化学家将进行D2OL的调整，以更好的在有效Agouron药物和鼻病毒3CL-PRO间找到平衡点。对于非科学家来说，这部分的实验称为"调控"是任何一个实验的基础。调控是科学和戏法魔术间的本质区别。

SARS目标IV